Jednostki podległe

W czasie pokoju Dowództwo dowodzi, poprzez Centrum Operacji Powietrznych, i Centrum Operacji Morskich, siłami i środkami wydzielanymi do pełnienia dyżurów bojowych w celu ochrony granicy państwowej w przestrzeni powietrznej RP, a także wsparcia Morskiego Oddziału Straży Granicznej, w celu ochrony obszarów morskich. Od 1 lipca 2014 roku powołano Centrum Operacji Lądowych - Dowództwo Komponentu Lądowego, które powstało na bazie rozformowanego 2 Korpusu Zmechanizowanego.